Tips, tutoriels pour R et RStudio

Comment créer une légende manuellement pour un ggplot

Pour contrôler tous les éléments d’une légende, le titre, les couleurs et les labels, il y a la fonction scale_color_manual().
Aug 19, 2025
3 min

Corriger une liste de chaines de caractères à l’aide d’un dictionnaire

C’est un problème assez classique rencontré par exemple quand on veut standardiser une liste de noms.
Ainsi, en métabolomique, suivant les bases de données utilisées et les…
Jul 15, 2025
1 min

Diagramme de Venn

Un…
May 20, 2025
12 min

Package ggstackplot

Ou comment empiler des courbes
Le package ggstackplot permet de créer des graphiques composés d’empilement de courbes. C’est par exemple le cas de l’évolution de courbes de températures au cours du temps.
Il repose sur le…
Mar 18, 2025
7 min

Package ggbreak

Ou comment afficher des axes discontinus
Le package ggbreak permet de créer des axes brisés sur un graphique ggplot.
C’est particulièrement utile sur un barplot quand…
Feb 3, 2025
3 min

Contrôler l’ouverture d’un projet dans RStudio

Ou comment contrôler la version de R au lancement d’un projet dans RStudio
On utilise le logiciel rig: https://github.com/r-lib/rig
C’est un logiciel qui s’installe à côté de R et RStudio.
Feb 3, 2025
0 min

Package downloadthis

Ou comment créer un bouton de téléchargement
Le package Downloadthis permet de créer un bouton de téléchargement dans une page HTML produite par un rmarkdown ou un quarto.
Ce bouton permet d’exporter toute sorte d’objet, que ce soit des objets R, des graphiques ggplot, des data frames sous forme de fichier .csv ou .xlsx ou n’importe quel…
Jan 20, 2025
4 min

RCy3

Ou comment personnaliser un réseau dans R via Cytoscape
Cytoscape est un logiciel gratuit qui fait référence dans la visualisation et la manipulation des réseaux. Il bénéficie d’une grande communauté et tout…
Oct 31, 2024
19 min

Comment choisir une version de R spécifique au démarrage de RStudio en 1 clic

RStudio nous donne la possibilité d’utiliser n’importe quelle version de R installée.
Sep 12, 2024
0 min

Data first, nom d’un pipe

Ou comment utiliser les pipes sans se faire piéger
Pour rappel un pipe permet de chaîner plusieurs processus de sorte que la sortie d’un processus alimente directement l’entrée du processus suivant Définition wikipedia
Jul 24, 2024
2 min

Package pak

Le package pak https://pak.r-lib.org/index.html permet l’installation de packages R depuis différents dépôts distants ou locaux de manière rapide, sécurisée et facile.
Jul 24, 2024
1 min

Comment combiner des chaines de chaines de caractères de plusieurs lignes en une seule par groupe

Prenons un tableau comprenant la répartition des villes américaines dans les états, régions et divisions
May 29, 2024
0 min

Comment couper un jeu de données en 2

Il s’agit d’une étape essentielle pour de nombreux modèles d’apprentissage automatique.
May 29, 2024
0 min

Rajouter des intervalles de confiance avec ggplot

On se propose de produire un graphique qui représente…
Mar 26, 2024
23 min

Croissance bacterienne: automatisation du calcul des métriques et des graphiques des courbes de croissance

Produire un graphique représentant les courbes de croissance mesurées par densité optique (DO) et prédites concernant différentes bactéries cultivées dans différents milieux.
Cela se traduit par un graphique par bactérie, avec pour chaque milieu, 2 courbes de mêmes couleurs, une en points pour les valeurs mesurées et une en ligne pour les…
Dec 19, 2023
16 min

Comment exporter plusieurs graphiques avec la fonction map()

A partir du jeu de données iris, on veut produire des scatterplot entre les variables Sepal.Length et Sepal.Width pour chaque espèce d’iris.
Dec 13, 2023
1 min

Bibliométrie

Obtenir un tableau résumant le nombre d’articles publiés par chaque équipe de GenPhySE (INRAe) par année
Nov 14, 2023
7 min

Convertir une liste en data frame en rajoutant les names de la liste en tant que colonne du data frame

Comme annoncé dans le titre, on veut convertir une liste en data frame en rajoutant les names de la liste en tant que colonne du data frame.
Oct 18, 2023
1 min

Produire un tableau de résultats de modèles linéaires avec les packages purrr et flextable

On dispose d’un jeu de données (fictif) dans lequel 7…
Oct 6, 2023
13 min

Comment ajouter des caractères spéciaux et des emojis à un document quarto ?

Comment ajouter des caractères spéciaux et égayer un document quarto avec des emojis ?
Oct 6, 2023
0 min

Tutoriel package purrr

Le package purrr contient toute une panoplie d’outils pour travailler avec les fonctions et les vecteurs.
Ce tuto présente quelques unes de ces fonctions.
Oct 6, 2023
10 min

Code styling

Good coding style is like correct punctuation: you can manage without it, butitsuremakesthingseasiertoread
Sep 28, 2023
16 min

Visualisation des données avec le package gtExtras

Il est souvent utile de commencer par afficher un aperçu d’un jeu de données avant de se lancer dans des analyses statistiques.
Sep 22, 2023
0 min

Validation visuelle des hypothèses d’un modèle

Le package performance propose de nombreuses fonctions pour évaluer la qualité d’un modèle.

On trouve notamment la fonction check_model qui permet une vérification…
Sep 22, 2023
0 min

Guidelines pour modèles mixtes

Ce tutoriel se propose de fournir quelques repères pour mener à bien une analyse statistique à l’aide d’un modèle mixte.
Sep 20, 2023
10 min
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